Modele de la molecule d`eau

Regardez une goutte d`eau filmée en ultra-Slow-Motion à 2000 images par seconde et une vidéo montrant le mouvement des molécules d`eau se déplaçant à travers le canal d`eau de la membrane, l`aquaporine. Le modèle d`eau flexible simple point-charge (ou modèle flexible d`eau SPC) est une reparamétrilisation du modèle d`eau SPC à trois sites. 11 [12] le modèle SPC est rigide, tandis que le modèle flexible SPC est flexible. Dans le modèle de Toukan et Rahman, l`étirement O – H est fait anharmonique, et donc le comportement dynamiques est bien décrit. Il s`agit de l`un des modèles d`eau à trois centres les plus précis, sans tenir compte de la polarisation. Dans les simulations de dynamique moléculaire, il donne la bonne densité et la permittivité diélectrique de l`eau. La molécule H2O a dix électrons associés, huit de l`atome d`oxygène et un à chacun des deux atomes d`hydrogène [13]. Sa structure électronique a été proposée comme 1sO 2.00 2sO 1,82 2pxO 1.50 2pzO 1.12 2pyO 2.00 1sH 20.78 1sH [71], avec la paire interne 1sO d`électrons non hybridés. Cependant, il apparaît maintenant que l`orbitale 2S peut également être effectivement non hybridé avec l`angle de liaison élargi de l`angle (alors) attendu de 90 ° c en raison de la répulsion stérique et ionique entre les atomes d`hydrogène chargés partiellement-positivement (comme proposé par Pauling Il y a plus de 50 ans [99]). Les orbitales moléculaires de l`eau, (1a1) 2 (2A1) 2 (1b2) 2 (3A1) 2 (1B1) 2 (4A1) 0 (2b2) 0 sont affichées sur une autre page. En raison de la présence de ces charges et de la nature pliée de la molécule, le centre de la charge positive (à mi-chemin entre les deux atomes d`hydrogène) ne coïncide pas avec le centre de la charge négative (sur l`atome d`oxygène).

Dans l`eau liquide, cela donne un moment dipôle moléculaire du centre de la charge négative au centre de charge positive, équivalent à une charge négative unitaire (c`est-à-dire un électron) séparée d`une charge positive unitaire par 0,061 nm. La présence de ce moment dipolaire dans toutes les molécules d`eau provoque sa nature polaire. Le diamètre moyen du Van der Waals de l`eau a été rapporté comme identique à celui du néon isoélectronique (2,82 Å) [112]. Les valeurs des modèles moléculaires et les données de distribution radiale de crête intermédiaire indiquent toutefois qu`il est un peu plus grand (≈ 3,2 Å).